Được đưa vào sử dụng từ năm 2000, với kiến trúc độc đáo xây dựng kiểu đài xen, có biểu tượng trống đồng Ngọc lũ và các hoa văn dân tộc. Với địa tế đẹp ở ngay chính ngã tư, trung tâm thị xã, hai mặt tiền một mặt cạnh đường quốc lộ 4c đường Hà Giang - Đồng Văn, Một mặt giáp trục đường lớn qua cầu Yên Biên I nối phường Nguyễn Trãi với phường Trần Phú, phía sau soi bóng xuống dòng sông Lô thơ mộng.
Bảo tàng có 02 tầng:
- Tầng 1: triển lãm chuyên đề và khu cửa chính của bảo tàng là gian long trọng (có tượng Lãnh tụ Hồ Chí Minh).
- Tầng 2: được bố trí nhiều gian và chia ra làm 2 mảng:
+ Mảng dân tộc học: trưng bày nhiều tổ hợp của 22 dân tộc anh em.
+ Mảng khảo cổ học: trưng bày nhiều hiện vật từ thời tiền sử. Hà Giang là cái nôi của người Việt cổ.
Ngoài ra còn trưng bày một số tư liệu, hiện vật các thời kỳ chống Pháp, chống Mỹ và công cuộc đổi mới của Tỉnh, của đất nước.
Hàng năm bảo Tàng tỉnh đón tiếp hàng ngàn lượt người trong và ngoài tỉnh đến tham quan và nghiên cứu.
Bảo tàng Tỉnh là nơi giáo dục truyền thống cho các thế hệ nhân dân các dân tộc Tỉnh Hà Giang